More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7169 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 238 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  44.3 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  44.12 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  46.03 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.47 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  44.54 
 
 		 237 aa  184  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  41.96 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  40.72 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  39.64 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  40.72 
 
 		 234 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 237 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 237 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 237 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 237 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 237 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 237 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  42.53 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.11 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  42.08 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  39.64 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 276 aa  131  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  42.67 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  37.39 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  41.33 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 418 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  37.44 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  37.67 
 
 		 332 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  41.48 
 
 		 239 aa  124  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  39.24 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 		 258 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  31.56 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  30.08 
 
 		 417 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  32.77 
 
 		 417 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  31.2 
 
 		 413 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 290 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 		 270 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 293 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 272 aa  85.5  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 		 272 aa  85.1  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54648  1-Acyl dihydroxyacetone phosphate reductase  27.31 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.329924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85576  1-acyl dihydroxyacetone phosphate reductase  27.78 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.764393  hitchhiker  0.00283469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3311  short chain dehydrogenase  31.1 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0701949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  36 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.27 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37020  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  29.52 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10399  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03370)  33.7 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.94715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00216  conserved hypothetical protein  32.21 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110281  normal  0.352442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2258  oxidoreductase  30.49 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.188796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>