More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1569 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 247 aa  496  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  52.89 
 
 		 243 aa  254  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  52.1 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  52.28 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  47.92 
 
 		 244 aa  214  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  36.17 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  40.64 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  39.56 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  36.93 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  43.3 
 
 		 237 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  43.64 
 
 		 332 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  37.33 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  38.67 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  36.44 
 
 		 234 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  36.28 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  41.4 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 		 235 aa  109  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  36.53 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  29.78 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 		 234 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  36.49 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  31.76 
 
 		 417 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  32.3 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  30.04 
 
 		 417 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  37.74 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 		 237 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  35.68 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  29.95 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 233 aa  88.6  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 		 291 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.9 
 
 		 272 aa  85.9  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 268 aa  85.1  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.41 
 
 		 275 aa  85.1  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3231  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  34.22 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  29.56 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  27.59 
 
 		 301 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  30.57 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.42 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>