More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2181 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  55.26 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  53.39 
 
 		 234 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  53.39 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  52.25 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  52.25 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  52.25 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  53.39 
 
 		 234 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  51.53 
 
 		 239 aa  198  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  51.09 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.02 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  46.7 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  48.64 
 
 		 233 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 276 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  48.44 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  51.42 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  46.58 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  52.36 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.19 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  48 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  48.84 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  50.7 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  49.08 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.19 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  41.3 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 243 aa  158  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  45.16 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.29 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.29 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  47.27 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  44.7 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  44.7 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  40.53 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  36.77 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  46.79 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  35.54 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  32.92 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  36.77 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  33.52 
 
 		 304 aa  99.4  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  32.17 
 
 		 244 aa  95.5  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  34.02 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  37.57 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 273 aa  85.5  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 		 249 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.526934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  34.64 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  29.66 
 
 		 847 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  33.33 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  29.71 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  32.24 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  31.54 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  31.64 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.012898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0259011  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  34.08 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  32.95 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  32.95 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0150364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1384  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.95107 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.311099  normal  0.357873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>