More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1856 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  39.41 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  40.43 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  40.17 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  37.87 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  36.16 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  33.92 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  36.91 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  30.4 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  33.93 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  33.63 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 227 aa  118  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  36.52 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  34.36 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  30.43 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  32.6 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  32.75 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  33.77 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  28.74 
 
 		 417 aa  99.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  30.2 
 
 		 417 aa  98.6  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  30.97 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  30.7 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  30.7 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  31.14 
 
 		 231 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  27.69 
 
 		 279 aa  93.6  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  27.98 
 
 		 413 aa  91.7  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.16 
 
 		 271 aa  88.6  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 		 317 aa  88.6  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34.51 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1387  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  31.32 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1347  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.39 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36881  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.12 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1505  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.22 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0160485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1440  short chain dehydrogenase  31.03 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4607  short chain dehydrogenase  31.03 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1462  short chain dehydrogenase  31.03 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53846  1-Acyl dihydroxyacetone phosphate reductase ribitol 2-dehydrogenase  31.12 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0980  short chain dehydrogenase  31.03 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  32.51 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  33 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1384  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.95107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  31.22 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>