More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4878 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
237 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  96.62 
 
 
237 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  96.62 
 
 
237 aa  447  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.26 
 
 
243 aa  391  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  52.56 
 
 
235 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
242 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.41 
 
 
258 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.69 
 
 
233 aa  204  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  49.34 
 
 
227 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  49.15 
 
 
228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  48.72 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  48.72 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  46.35 
 
 
231 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
276 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  42.24 
 
 
233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  42.5 
 
 
232 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  45.26 
 
 
234 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
245 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  44.83 
 
 
234 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  45.73 
 
 
234 aa  141  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  43.97 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  43.97 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  43.97 
 
 
234 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  43.98 
 
 
234 aa  138  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 
234 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  45.61 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  44.3 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  43.22 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  42.7 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  41.74 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  44.74 
 
 
234 aa  128  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  40.17 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  40.17 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  40.17 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  40.17 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  40.17 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  40.17 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 
237 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 
235 aa  125  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  40.17 
 
 
234 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  41 
 
 
332 aa  121  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
243 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  36.93 
 
 
245 aa  115  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  33.63 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 
265 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 
264 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
250 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
235 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
247 aa  99  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
268 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  36.24 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
247 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
300 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09940  short-chain alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 
264 aa  95.1  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.920602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
271 aa  94  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
275 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
223 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
269 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
268 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  32.74 
 
 
304 aa  92.4  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  36.31 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
239 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
239 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.32 
 
 
238 aa  91.7  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
338 aa  90.9  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
250 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.372052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35.03 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  39.23 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
270 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 
277 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
270 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
284 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  33.69 
 
 
244 aa  88.6  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
266 aa  88.6  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
250 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
270 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 
281 aa  88.2  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  30.91 
 
 
277 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 
284 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>