More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0036 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  56.77 
 
 		 233 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.33 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.33 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  58.48 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  58.62 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  58.62 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  58.62 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  58.62 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  58.62 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  58.62 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  58.93 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  57.76 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  57.76 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  57.76 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  57.76 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  56.47 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  57.21 
 
 		 234 aa  235  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  58.08 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  55.9 
 
 		 234 aa  231  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  59.82 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  56.9 
 
 		 332 aa  225  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  55.46 
 
 		 234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  52 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.81 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  48.9 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  46.9 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.35 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 		 242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  50.66 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  53.67 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  44.78 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  50.22 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  50.22 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  50.66 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.84 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  51.15 
 
 		 235 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  43.1 
 
 		 244 aa  168  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  44.84 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  38.39 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  40.69 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  47.27 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  36.28 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 		 239 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  36.09 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  37.24 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  40.76 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  31.76 
 
 		 413 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  37.08 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 		 272 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 347 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 		 418 aa  99  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  31.65 
 
 		 417 aa  99  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 300 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 		 286 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  36.31 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 314 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  42.2 
 
 		 298 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 270 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  30.51 
 
 		 417 aa  95.5  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 		 338 aa  95.1  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 274 aa  94.7  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  40.83 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 317 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.48 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 		 293 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 275 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4721  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 		 285 aa  92.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 281 aa  91.7  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 261 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  32.05 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.16 
 
 		 258 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 250 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>