More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10890 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  100 
 
 		 235 aa  467  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.74 
 
 		 242 aa  281  8.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.23 
 
 		 233 aa  264  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.57 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  52.63 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.27 
 
 		 237 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.27 
 
 		 237 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.71 
 
 		 243 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.56 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  50.44 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 		 276 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 		 232 aa  197  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  48.9 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  49.56 
 
 		 231 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  45.58 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  50.44 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.7 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  48.86 
 
 		 234 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  46.23 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  49.12 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 332 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  50.23 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  47.37 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  48.86 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  48.65 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  45.29 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  45.29 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  45.29 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.68 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.68 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  44.39 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  45.5 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  44.69 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  45.06 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  38.79 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.59 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  39.67 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  34.76 
 
 		 244 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  37.31 
 
 		 279 aa  99.4  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  34.53 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  32.43 
 
 		 304 aa  95.9  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 300 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 266 aa  88.6  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 270 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 		 267 aa  88.6  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 		 317 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 		 271 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3194  short chain dehydrogenase  31.07 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 272 aa  85.5  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 		 274 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.86 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35950  putative dehydrogenase  35.26 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392824  hitchhiker  0.00000000000000176535 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1121  short chain dehydrogenase  30.1 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0921359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  33.52 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  33.52 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  29.24 
 
 		 413 aa  82.4  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 338 aa  82  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>