More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13195 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 235 aa  461  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  52 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  50.21 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 		 241 aa  188  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  50.46 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  49.08 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.77 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.2 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 276 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  45.29 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  51.15 
 
 		 232 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  50.44 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  45.5 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  44.78 
 
 		 245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  44.64 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  45.54 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  45.09 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  45.09 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  46.61 
 
 		 256 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  46.88 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.54 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  47.11 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  43.97 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  46.19 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  47.95 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  47.2 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.5 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.5 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  39.64 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  42.92 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  43.84 
 
 		 234 aa  134  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 237 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  38.05 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  30.4 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  36.61 
 
 		 282 aa  93.2  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 268 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 		 273 aa  89.4  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 		 275 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5800  short chain dehydrogenase  36.67 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3866  short chain dehydrogenase  36.67 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  32.09 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4503  short chain dehydrogenase  36.67 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1347  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.371645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  34.86 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  31.34 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 274 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 413 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 274 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 281 aa  85.9  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 		 290 aa  85.5  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 		 293 aa  85.5  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.31 
 
 		 261 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 285 aa  85.1  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  31.51 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0401  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  38.01 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0616963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1864  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.03 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  33.7 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748494  normal  0.932613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 		 418 aa  82  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.717982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>