94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0664 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  89.26 
 
 		 243 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  62.55 
 
 		 248 aa  317  7.999999999999999e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  57.72 
 
 		 249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  57.44 
 
 		 256 aa  291  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  57.44 
 
 		 256 aa  291  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  56.07 
 
 		 245 aa  289  3e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  53.25 
 
 		 264 aa  271  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  55.1 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  55.65 
 
 		 239 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  52.72 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  52.72 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  52.72 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  56.85 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  53.75 
 
 		 250 aa  261  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  54.39 
 
 		 253 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  55.19 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  54.36 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  55.19 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  54.77 
 
 		 262 aa  256  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  52.7 
 
 		 248 aa  251  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  54.62 
 
 		 246 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  55.46 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  54.24 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  44.63 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  44.21 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  45.11 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  45.68 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  42.79 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  42.39 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  41.15 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  40.33 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  39.42 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  41.39 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  39.06 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  40.74 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  30.36 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  36.55 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  35.86 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  28.34 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  31.96 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  38.36 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  32.21 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  28.65 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  30.82 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  33.12 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  23.04 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  26.95 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  26.95 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  26.95 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  30.06 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  27.71 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  28.37 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  27.88 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  29.56 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  36.67 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  28.09 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  26.35 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  22.1 
 
 		 253 aa  48.5  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  29.75 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1123  DNA repair protein RecO  29.49 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1402  DNA repair protein RecO, putative  29.49 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  21.4 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  23.83 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2973  DNA repair protein RecO  31.87 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318586  hitchhiker  0.00228518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  20.74 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  29.8 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  24.52 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  29.73 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  26.58 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  30.56 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  30.37 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  27.44 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  28.72 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  26.03 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  26.28 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  24.76 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  28.73 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  26.7 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1633  DNA repair protein RecO  30.2 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.183624  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2084  DNA repair protein RecO  28.19 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.987652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  29.14 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  24.86 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  25.97 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  37.29 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 279 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>