212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0406 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  31.84 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  33.97 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  24.81 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2037  recombination protein O, RecO  32.69 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0117854  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  32.69 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  32.48 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  29.87 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  36.08 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  22.62 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  34.67 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  25.4 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  32.69 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  32.48 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  31.73 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  32.26 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  19.67 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  29.85 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  29.38 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  20.66 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  30.92 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  26.88 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  26.97 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  28.86 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  28.11 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  28.63 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  21.4 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  32.45 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  36.07 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  33.11 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  25.51 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  29.72 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  32.5 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  24.18 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  27.97 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  32.52 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  27.22 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  31.91 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  27.27 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  28.33 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 248 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  29.08 
 
 		 281 aa  62  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  32.03 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  31.13 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0415  DNA repair protein RecO  29.3 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  28.26 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0408  DNA repair protein RecO  29.76 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  33.11 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  32.45 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  30.47 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  25.75 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  28.99 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  25.83 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  29.39 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  23.64 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0652  DNA replication and repair protein RecO  30.98 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10662  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  25.95 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  33.61 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  34 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  30.73 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  23.39 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  23.77 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  31.45 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  22.54 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  25.32 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  28.46 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  30.86 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1016  DNA repair protein RecO  32.67 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1012  DNA repair protein RecO  32.67 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  27.82 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  34.34 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  25.95 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2031  DNA repair protein RecO  34.15 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0971735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0656  DNA repair protein RecO  32.28 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1094  DNA repair protein RecO  32.28 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1136  DNA repair protein RecO  32.28 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  23.72 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  24.64 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4248  DNA repair protein RecO  32.67 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  27.85 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  29.94 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  21.67 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  31.1 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  42.86 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  31.17 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2897  DNA repair protein RecO  28.75 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.64605  normal  0.158668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0642  DNA repair protein RecO  31.72 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.272971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>