28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1674 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  42.92 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  40.18 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  48.18 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  31.86 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  36.91 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  31.44 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  31.06 
 
 		 237 aa  88.6  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  31.6 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  30.66 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  32.84 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  32.84 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0736  DNA repair protein RecO  28.93 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.394466  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  29.2 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  28.99 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  30.57 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  27.21 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  23.81 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  30.43 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  28.47 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  24.86 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  28.97 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0794  recombination protein O, RecO  27.86 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0642  DNA repair protein RecO  25.97 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.272971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  25.93 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  27.59 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  26.09 
 
 		 241 aa  42  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>