19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0706 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  100 
 
 
237 aa  475  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  45.19 
 
 
238 aa  209  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  42.86 
 
 
238 aa  180  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  34.03 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  31.67 
 
 
230 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  33.05 
 
 
224 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  29.22 
 
 
241 aa  109  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  33.48 
 
 
217 aa  95.9  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  27.76 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  21.84 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  26.19 
 
 
257 aa  52.4  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  26.47 
 
 
261 aa  48.9  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  25.83 
 
 
253 aa  47  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  27.39 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  24.84 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  26.82 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  20.99 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2764  DNA repair protein RecO  25.26 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>