34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3301 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  46.49 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  44.59 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  38.75 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  35.8 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  48.18 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  40.65 
 
 		 238 aa  121  9e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  29.75 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  33.05 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  25.71 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  31.25 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  29.38 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  28.41 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  28.74 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  30.19 
 
 		 283 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  29.94 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  27.81 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  21.47 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  22.97 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2037  recombination protein O, RecO  28.66 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0117854  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  22.3 
 
 		 260 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  25.83 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0736  DNA repair protein RecO  26.76 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.394466  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  26.28 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  25.23 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  29.91 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  24.31 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 254 aa  42.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 241 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 241 aa  42  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 241 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  26.43 
 
 		 236 aa  42  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>