42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4044 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  51.3 
 
 		 230 aa  247  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  44.59 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  38.93 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  40.18 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  33.61 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  34.02 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  33.47 
 
 		 238 aa  128  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  26.14 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  30.92 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  30.97 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  26.97 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  26.97 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  31.65 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  22.3 
 
 		 260 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  26.32 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0736  DNA repair protein RecO  27.7 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.394466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  29.29 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2037  recombination protein O, RecO  27.39 
 
 		 264 aa  45.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0117854  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  23.98 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  27.86 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  27.86 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  27.86 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  28.19 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  22.64 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  24.84 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  26.71 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 		 245 aa  42  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 		 245 aa  41.6  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  25.71 
 
 		 243 aa  41.6  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 253 aa  41.6  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>