20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2009 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  28.46 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  29.18 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  27.8 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  27.76 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  26.78 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  25.71 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  27.87 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  26.14 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  25.84 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  23.36 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  22.31 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  23.81 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  24.05 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  24.49 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  22.63 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  25.81 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  24.38 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  25.95 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  24.51 
 
 		 250 aa  42  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>