109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0203 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 261 aa  531  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  48.26 
 
 		 264 aa  267  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  40.15 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  41 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  42.08 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  41.15 
 
 		 283 aa  215  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2037  recombination protein O, RecO  38.64 
 
 		 264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0117854  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  32.69 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  31.25 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  26.5 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  28.49 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  29.82 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  25.51 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  25.11 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  27.56 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  22.76 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  26.86 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  26.71 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  23.39 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  25.79 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  21.89 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  27.42 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  24.07 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  24.85 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  21.81 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  25 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  33.12 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  25.14 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  28.22 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1264  DNA repair protein RecO  25.11 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  27.56 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  24.22 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  23.27 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  24.87 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  28.8 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  26.06 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  24.6 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  24.34 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  21.05 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  23.36 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  20.58 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  26.36 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  21.97 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  19.75 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  24.53 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  26.38 
 
 		 283 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  27.16 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  20.16 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  21.37 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  21.37 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  21.37 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  21.37 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  21.37 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  21.37 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0596  DNA repair protein RecO  29.3 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  26.97 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  24.71 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  25.9 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  24.27 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  23.31 
 
 		 283 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  25.31 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  24.2 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  24.84 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  24.84 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  24.84 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  24.85 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  30.43 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  22.93 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  22.93 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  22.93 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  26.97 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  26.97 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  22.22 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  23.35 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  24.2 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0914  DNA repair protein RecO  21.9 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  23.72 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  22.93 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  19.34 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  24.06 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  23.81 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  24.08 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  25 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  23.81 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  23.6 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  26.06 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  26.06 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  26.75 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  27.95 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0652  DNA replication and repair protein RecO  28.57 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10662  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  20.85 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2031  DNA repair protein RecO  28.77 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0971735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  23.62 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>