75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0914 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0914  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1264  DNA repair protein RecO  48.22 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2035  DNA repair protein RecO  44 
 
 		 248 aa  191  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000013489  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0289  Recombination protein O RecO  47.42 
 
 		 506 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.236131 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1688  DNA repair protein RecO  42.63 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0524838 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0991  DNA repair protein RecO  39.6 
 
 		 247 aa  152  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  25.4 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  29.12 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  25.1 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  27.08 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  23.22 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  28.65 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  28.93 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  26.78 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  27.73 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  27.69 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  24.58 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  25.73 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  25.73 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  28.88 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  26.37 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  25.21 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  28.12 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  29.08 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  27.67 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  19.52 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  25.46 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  25.82 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  28.42 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  22.45 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  25.61 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  32.76 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  23.55 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  32.18 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  29.89 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  32.18 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  28.39 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  24.87 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  25.93 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  23.08 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  21.9 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  23.26 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  25.51 
 
 		 300 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  27.4 
 
 		 275 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  23.43 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  21.92 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 269 aa  45.4  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  26.03 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  26.53 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  22.84 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  25.21 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  21.05 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  23 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  25.41 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  25.52 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  27.39 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  19.89 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  23.29 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  20.43 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  23.27 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  27.75 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  25.73 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  28.4 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  26.99 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  28.49 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  26.45 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  20.3 
 
 		 263 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  26.86 
 
 		 246 aa  42.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  21.51 
 
 		 248 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0855  DNA repair protein RecO  23.5 
 
 		 243 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  0.155378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  25.41 
 
 		 281 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  26.92 
 
 		 258 aa  42  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>