93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1264 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1264  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2035  DNA repair protein RecO  57.37 
 
 		 248 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000013489  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0289  Recombination protein O RecO  60.28 
 
 		 506 aa  264  8e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.236131 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0914  DNA repair protein RecO  48.22 
 
 		 250 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0991  DNA repair protein RecO  46 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1688  DNA repair protein RecO  39.84 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0524838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  28.87 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  23.69 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  24.31 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  29.29 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  30.67 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  30.51 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  22.59 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  29.08 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  29.46 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  28.28 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  21.72 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  30.13 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  30.13 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  25.52 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  27.57 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  29.51 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  29.89 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  29.72 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  27.8 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  26.56 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  28.28 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  26.14 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  28.14 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  28.98 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  23.79 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  27.24 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  27.05 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  30.25 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  27.16 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  28.22 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  22.71 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  28.1 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  24.9 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  24.04 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  29.71 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  30.63 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  16.87 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  22.12 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  29.46 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  27.05 
 
 		 300 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  29.53 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  21.49 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  21.9 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  21.34 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  22.12 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  28.83 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  27.02 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  28.26 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  29.74 
 
 		 269 aa  48.5  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  18.44 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  29.92 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  23.43 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  26.8 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  27.08 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  18.44 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  18.44 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  29.13 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  18.44 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  25.53 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  18.44 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  18.44 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  24.31 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  18.44 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  27.94 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  28.3 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  22.55 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  18.44 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  20.33 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  24.73 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  18.44 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  23.94 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  27.31 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  27.22 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  25.73 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  18.44 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  18.44 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  27.22 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  18.44 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  22.55 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  25.98 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  22.09 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>