127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1979 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 271 aa  533  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  32.81 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  26.17 
 
 		 248 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  26.56 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  26.56 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  26.56 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  26.56 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  26.56 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  26.56 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  26.56 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  26.95 
 
 		 248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  25.78 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  28 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  26.17 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  28.23 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  24.27 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  26.64 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  27.07 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  23.05 
 
 		 248 aa  89  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  26.64 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  30.48 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  25.4 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  25.4 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  25.28 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  35.36 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  25.32 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  20.95 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  26.41 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  25.47 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  25.47 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  24.02 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  28.06 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  28.23 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  24.02 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  23.29 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  24.51 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  23.78 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  30.35 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  26.95 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  29.09 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  29.15 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  28.04 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0173  DNA repair protein RecO  20 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000014605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  33.15 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  33.56 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  31.54 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  22.18 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  22.92 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  28.34 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  32.43 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  29.67 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  31.38 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  25.79 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  24.31 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  28.02 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  24.02 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  30.43 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  29.89 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  36.7 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  36.7 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  30.43 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  28.57 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  20.96 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  31.89 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  30.17 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  32.46 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  30.6 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  29.35 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  29.76 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  30.65 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  29.19 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  32.26 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  35.98 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  25.61 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  28.24 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  28.97 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  32.28 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  29.44 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0855  DNA repair protein RecO  31.55 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  0.155378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  28.95 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  27.72 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  22.09 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  27.57 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  33.88 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  27.42 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  21.09 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  28.11 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  28.11 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  28.11 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  29.57 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  27.42 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>