192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1346 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  100 
 
 
248 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  32.13 
 
 
251 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  30.33 
 
 
263 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  29.39 
 
 
244 aa  135  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  29.55 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  31.28 
 
 
262 aa  134  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  30.5 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  29.1 
 
 
263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  28.05 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  28.46 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  30.36 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  28 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  28.86 
 
 
283 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  29.8 
 
 
251 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  31.09 
 
 
246 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  30.83 
 
 
245 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  32.52 
 
 
239 aa  124  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  26.1 
 
 
251 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  27.6 
 
 
279 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  27.53 
 
 
249 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  29.1 
 
 
243 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  29.51 
 
 
250 aa  123  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  29.05 
 
 
243 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  29.71 
 
 
256 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  27.64 
 
 
265 aa  122  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  28 
 
 
300 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 
260 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  27.53 
 
 
243 aa  121  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  26.83 
 
 
252 aa  121  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  29.55 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  26.27 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 
270 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  27.8 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  24.29 
 
 
267 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  25.51 
 
 
276 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  25.51 
 
 
276 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  25.51 
 
 
276 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  32.13 
 
 
250 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  28.45 
 
 
250 aa  118  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  28.63 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  28.63 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  28.63 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  28.63 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  27.13 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  28.63 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  28.22 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  28.63 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  29.44 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  27.8 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  29.13 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  25.91 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  28.22 
 
 
248 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  27.24 
 
 
243 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  25.61 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  29.51 
 
 
258 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  28.23 
 
 
243 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  28.16 
 
 
248 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  26.86 
 
 
279 aa  112  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  27.8 
 
 
248 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  25.7 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  23.58 
 
 
253 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  26.69 
 
 
269 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  26.53 
 
 
270 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  31.03 
 
 
250 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  25.1 
 
 
254 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 
249 aa  102  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  28.63 
 
 
263 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  28 
 
 
244 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  28.29 
 
 
248 aa  100  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  26.23 
 
 
273 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  27.86 
 
 
248 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  24.59 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  26.48 
 
 
257 aa  96.3  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  27.62 
 
 
244 aa  95.1  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  28.92 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  27.24 
 
 
257 aa  94  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  25 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  29.44 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  23.05 
 
 
271 aa  89  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  24.69 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  26.72 
 
 
244 aa  86.3  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  24.35 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  25.71 
 
 
262 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  32.45 
 
 
217 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  24.35 
 
 
273 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  29.19 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  26.59 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  32.68 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  23.4 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  26.61 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  26.59 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  22.39 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  25.5 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  28.5 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  24.9 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  23.98 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  27.96 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  28.93 
 
 
302 aa  78.6  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  24.49 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>