56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0289 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0289  Recombination protein O RecO  100 
 
 		 506 aa  1003    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.236131 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1264  DNA repair protein RecO  60.28 
 
 		 251 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2035  DNA repair protein RecO  55.25 
 
 		 248 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000013489  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0914  DNA repair protein RecO  47.42 
 
 		 250 aa  186  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0991  DNA repair protein RecO  46.12 
 
 		 247 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1688  DNA repair protein RecO  41.74 
 
 		 252 aa  160  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0524838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  32.04 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  27.52 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  30.43 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  30.16 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  30.27 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  28.1 
 
 		 253 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  28.96 
 
 		 243 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  26.09 
 
 		 253 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 		 248 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  25.48 
 
 		 262 aa  53.9  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  27.57 
 
 		 256 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  29.78 
 
 		 243 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  26.37 
 
 		 256 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  26.11 
 
 		 266 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  28.73 
 
 		 248 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  24.56 
 
 		 261 aa  50.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  28.42 
 
 		 245 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  27.72 
 
 		 244 aa  50.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  28.26 
 
 		 252 aa  50.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  29.03 
 
 		 279 aa  50.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  26.63 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  26.63 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 300 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  26.63 
 
 		 276 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  29.02 
 
 		 270 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  26.63 
 
 		 273 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  26.63 
 
 		 284 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  28.26 
 
 		 243 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 243 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  23.87 
 
 		 253 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  31.07 
 
 		 254 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  31.07 
 
 		 254 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  25.1 
 
 		 249 aa  47.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  29.35 
 
 		 250 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  26.47 
 
 		 250 aa  47  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  26.63 
 
 		 265 aa  47  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  26.4 
 
 		 258 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  23.86 
 
 		 251 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  23.78 
 
 		 260 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  27.81 
 
 		 271 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  29.79 
 
 		 250 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  29.38 
 
 		 246 aa  45.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  26.99 
 
 		 249 aa  45.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  20.78 
 
 		 248 aa  44.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  27.96 
 
 		 263 aa  44.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  26.25 
 
 		 250 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  27.7 
 
 		 217 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  21.74 
 
 		 258 aa  44.3  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  27.03 
 
 		 251 aa  43.9  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  28.92 
 
 		 244 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>