218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0725 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  29.75 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  26.61 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  28.79 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  25.94 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  27.62 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  25.52 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  25.1 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  26.5 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  26.77 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  26.77 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  26.77 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  26.77 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  26.77 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  26.77 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  26.77 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  26.77 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  26.77 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  25.52 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  25.86 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  24.9 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  25.76 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  31.25 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  25.3 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  25.76 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  26.97 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  30.11 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  28.81 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  30.11 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  27.17 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  29.31 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0652  DNA replication and repair protein RecO  32 
 
 		 274 aa  72  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10662  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  26.45 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2897  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.64605  normal  0.158668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  22.36 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1087  DNA repair protein RecO  29.05 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  28.05 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  26.72 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2462  DNA repair protein RecO  30.21 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.762702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2310  DNA repair protein RecO  27.94 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0770241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  24.17 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  28.1 
 
 		 336 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  22.46 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  26.5 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  26.51 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  27.51 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  28.44 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3633  DNA repair protein RecO  31.41 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  27.09 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  30.1 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  29.79 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  27.04 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  22.09 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  25.98 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  27.66 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  25.91 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  25.1 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  28.02 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  26.89 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  31.9 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  31.15 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  27.49 
 
 		 242 aa  62  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3059  DNA repair protein RecO  31.41 
 
 		 249 aa  62  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.763582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  26.19 
 
 		 275 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  26.19 
 
 		 275 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  26.19 
 
 		 275 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  26.19 
 
 		 275 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  26.19 
 
 		 275 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  26.19 
 
 		 286 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  26.19 
 
 		 286 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  22.39 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1402  DNA repair protein RecO, putative  32.3 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  31.16 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1123  DNA repair protein RecO  32.3 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  27.89 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  31.51 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2084  DNA repair protein RecO  29.53 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.987652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  27.03 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2168  DNA repair protein RecO  29.49 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  27.92 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  30.22 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  27.18 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  27.66 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  21.16 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1012  DNA repair protein RecO  25.71 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39895  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  26.29 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1016  DNA repair protein RecO  25.71 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1094  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0656  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1136  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  22.92 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>