103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2643 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  85.48 
 
 		 249 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  83.4 
 
 		 249 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  81.85 
 
 		 253 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  78.54 
 
 		 262 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  78.86 
 
 		 250 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  72.65 
 
 		 248 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  55.19 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  57.98 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  55.19 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  53.06 
 
 		 249 aa  258  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  54.55 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  55.19 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  55.19 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  51.84 
 
 		 250 aa  251  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  56.02 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  51.81 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  51.46 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  51.05 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  51.05 
 
 		 246 aa  242  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  53.91 
 
 		 264 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  52.54 
 
 		 239 aa  232  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  53.78 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  47.3 
 
 		 245 aa  221  8e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  53.36 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  46.53 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  45.13 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  45.98 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  44.69 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  43.78 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  42.22 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  43.72 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  40.89 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  40.41 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  44.31 
 
 		 243 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  43.78 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  42.06 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  37.4 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  40.44 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  36.98 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  29.22 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  32.16 
 
 		 240 aa  122  7e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  30.99 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  40.85 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  31.87 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  32.47 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  33.78 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  32.94 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1633  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.183624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  27.74 
 
 		 235 aa  52  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  27.54 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  27.54 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  29.89 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  27.54 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  29.03 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1377  DNA repair protein RecO  34.55 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  34.39 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1123  DNA repair protein RecO  29.88 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1402  DNA repair protein RecO, putative  29.88 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  27.92 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  30.77 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  30.92 
 
 		 286 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4747  DNA repair protein RecO  29.71 
 
 		 233 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2168  DNA repair protein RecO  33.14 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  22.7 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1446  DNA repair protein RecO  33.94 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.817511  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2973  DNA repair protein RecO  32.5 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318586  hitchhiker  0.00228518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  31.85 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0656  DNA repair protein RecO  32.24 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1012  DNA repair protein RecO  31.95 
 
 		 279 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39895  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1136  DNA repair protein RecO  32.24 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1094  DNA repair protein RecO  32.24 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1016  DNA repair protein RecO  31.95 
 
 		 279 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  22.87 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4248  DNA repair protein RecO  32.34 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54300  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  25.43 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  27.07 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2084  DNA repair protein RecO  27.13 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.987652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  25.17 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  25.85 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  23.56 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  23.44 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  25.93 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  27.62 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  31.91 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  28.47 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  23.65 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  28.39 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  23.86 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>