68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0047 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 251 aa  514  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  58.96 
 
 		 253 aa  315  3e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  55.6 
 
 		 257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  34.85 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  32.02 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  31.84 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  33.2 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  31.25 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  31.95 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  31.95 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  31.95 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  31.95 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  31.95 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  31.95 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  31.95 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  31.95 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  32.91 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  31.54 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  31.12 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  29.1 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  24.9 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  21.58 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  21.58 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  22.04 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  24.9 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  28.66 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  27.39 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  24.39 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  22.27 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  24.19 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  27.03 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  24.07 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  21.6 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  22.52 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  21.26 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  20.58 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  23.05 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  22.81 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  24.48 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  20.88 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  22.09 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  23.86 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  19.75 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  22.49 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  26.88 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  26.61 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  24.48 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  25.33 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  23.89 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0506  DNA repair protein RecO  22.31 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00293649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  25.79 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  24.84 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  26.43 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  26.43 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  20.76 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  26.49 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  23.6 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  18.82 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  23.98 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  24.56 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  26.83 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  27.43 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  22.76 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  23.86 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>