86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0693 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 249 aa  500  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  77.46 
 
 		 256 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  78.01 
 
 		 256 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  69.23 
 
 		 264 aa  348  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  61.79 
 
 		 248 aa  311  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  57.72 
 
 		 247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  57.72 
 
 		 247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  58.51 
 
 		 243 aa  301  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  58.55 
 
 		 239 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  55.24 
 
 		 249 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  54.81 
 
 		 246 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  54.81 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  55.23 
 
 		 246 aa  265  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  54.84 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  59.66 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  52.65 
 
 		 250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  53.06 
 
 		 254 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  52.36 
 
 		 253 aa  255  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  52.61 
 
 		 245 aa  253  3e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  53.11 
 
 		 248 aa  251  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  57.98 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  51.21 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  51.01 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  49 
 
 		 250 aa  242  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  49.58 
 
 		 242 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  43.66 
 
 		 234 aa  193  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  44.04 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  44.04 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  45.97 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  44.4 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  42.2 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  41.82 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  41.08 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  40.37 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  39.38 
 
 		 241 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  43.88 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  38.01 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  28.45 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  34.36 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  28.87 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  27.43 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  30.69 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  36.05 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  34.03 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  30.41 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  28.23 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  32.9 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  28.12 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1402  DNA repair protein RecO, putative  31.06 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1123  DNA repair protein RecO  31.06 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13820  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  29.88 
 
 		 291 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  30.41 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  29.38 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  27.44 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1377  DNA repair protein RecO  31.25 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  27.33 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  29.18 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1446  DNA repair protein RecO  30.63 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.817511  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0996  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  28.66 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  29.45 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  28.66 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  29.45 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2973  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 239 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318586  hitchhiker  0.00228518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  29.27 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  29.27 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  29.27 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1264  DNA repair protein RecO  26.52 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  27.16 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  24.85 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4215  DNA repair protein RecO  30.28 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.322545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3949  DNA repair protein RecO  29.86 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  29.68 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  21.69 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  26.25 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3059  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.763582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  24.52 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  26.25 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1435  DNA repair protein RecO  25.66 
 
 		 227 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  25.9 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  24.31 
 
 		 219 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>