99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3841 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 247 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  58.47 
 
 		 250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  57.5 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  57.08 
 
 		 246 aa  264  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  56.25 
 
 		 246 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  57.2 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  56.3 
 
 		 248 aa  258  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  54.62 
 
 		 249 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  54.62 
 
 		 249 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  53.23 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  58.16 
 
 		 246 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  51.21 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  51.81 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  54.29 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  52.42 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  52.82 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  54.24 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  54.24 
 
 		 256 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  54.24 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  54.24 
 
 		 256 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  56.9 
 
 		 267 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  52.12 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  52.32 
 
 		 264 aa  229  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  48.58 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  48.33 
 
 		 242 aa  214  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  44.44 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  44.44 
 
 		 239 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  43.29 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  43.21 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  41.74 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  42.49 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  42.15 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  44.68 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  43.72 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  39.51 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  44.68 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  38.79 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  29.79 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  39.5 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  38.68 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  30.58 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  30.09 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  27.5 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  28.76 
 
 		 192 aa  67  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  28.09 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 336 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  29.63 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 291 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  26.25 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  28.03 
 
 		 298 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  26.99 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1087  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  26.25 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2897  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.64605  normal  0.158668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  32.48 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  27.33 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  27.33 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  27.33 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  27.33 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  27.33 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  26.74 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  27.33 
 
 		 286 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1016  DNA repair protein RecO  29.88 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4248  DNA repair protein RecO  29.88 
 
 		 278 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1012  DNA repair protein RecO  29.88 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  30.87 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  42 
 
 		 242 aa  48.9  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  29.73 
 
 		 272 aa  48.5  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1094  DNA repair protein RecO  28.95 
 
 		 278 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1136  DNA repair protein RecO  28.95 
 
 		 278 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0656  DNA repair protein RecO  28.95 
 
 		 278 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0652  DNA replication and repair protein RecO  28.38 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10662  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  27.97 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  25.61 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2168  DNA repair protein RecO  27.71 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2973  DNA repair protein RecO  31.21 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318586  hitchhiker  0.00228518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  27.06 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  25.79 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  25.79 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  28.38 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  26.25 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  28.38 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  26.71 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  30.06 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  26.71 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  26.47 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  26.47 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  26.47 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  26.47 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  26.71 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1264  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  26.11 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  26.45 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0415  DNA repair protein RecO  24.29 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1377  DNA repair protein RecO  30.67 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  27.59 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  27.59 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>