59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2837 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 242 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  53.81 
 
 		 239 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  54.51 
 
 		 239 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  52.79 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  49.58 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  51.69 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  49.79 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  46.15 
 
 		 256 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  46.81 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  45.25 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  46.64 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  43.23 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  46.26 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  44.44 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  41.82 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  43.72 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  43.8 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  43.8 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  44 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  43.95 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  42.74 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  40.24 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  43.7 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  40.52 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  43.21 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  43.78 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  44.24 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  39.06 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  39.06 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  43.78 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  42.86 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  42.86 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  42.45 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  42.45 
 
 		 246 aa  151  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  43.27 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  40.76 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  43.44 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  40 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  43.44 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  30.3 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  32 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  33.84 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  34.67 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  31.08 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  36.78 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  30.23 
 
 		 298 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  32.19 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  28.21 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  23.94 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  29.01 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  26.8 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  31.79 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1123  DNA repair protein RecO  31.25 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1402  DNA repair protein RecO, putative  31.25 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  29.44 
 
 		 336 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  23.72 
 
 		 250 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  30.19 
 
 		 244 aa  42  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4747  DNA repair protein RecO  35.45 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>