102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4680 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 248 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  75.31 
 
 		 262 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  74.29 
 
 		 253 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  72.65 
 
 		 254 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  70.28 
 
 		 250 aa  354  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  69.08 
 
 		 249 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  69.64 
 
 		 249 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  58.44 
 
 		 242 aa  265  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  56.43 
 
 		 256 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  56.02 
 
 		 256 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  57.32 
 
 		 246 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  56.02 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  52.7 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  52.7 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  53.11 
 
 		 249 aa  251  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  57.32 
 
 		 246 aa  251  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  52.7 
 
 		 243 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  55.33 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  54.88 
 
 		 246 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  52.82 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  48.78 
 
 		 250 aa  232  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  54.81 
 
 		 239 aa  228  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  47.5 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  54.62 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  55.04 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  44.58 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  42.56 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  43.8 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  47.09 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  43.3 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  41.8 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  41.39 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  40.42 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  39.84 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  42.62 
 
 		 243 aa  155  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  42.45 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  40.09 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  29.76 
 
 		 244 aa  132  6e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  38.21 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  39.75 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  30.6 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  32.41 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  30.3 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  36.65 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  33.33 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  29.3 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  29.38 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  30.91 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  30.91 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  30.91 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2973  DNA repair protein RecO  34.16 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318586  hitchhiker  0.00228518 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  27.89 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  33.56 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  29.76 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  31.55 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  29.76 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  29.76 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  29.76 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  28.16 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1377  DNA repair protein RecO  33.94 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  29.17 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  30.41 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  28.74 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  26.24 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  35.06 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1446  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.817511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  29.09 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  36.91 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  27.98 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1123  DNA repair protein RecO  29.45 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1402  DNA repair protein RecO, putative  29.45 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  25.81 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  24.89 
 
 		 298 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  29.03 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  26.8 
 
 		 251 aa  45.4  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  29.22 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  26.71 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  25.52 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  31.72 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2084  DNA repair protein RecO  28.35 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.987652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  28.11 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  29.33 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  32.03 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  29.73 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0408  DNA repair protein RecO  23.23 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  24.09 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>