176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0909 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  100 
 
 		 242 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  34.08 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  30.9 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  30.3 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  31.85 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  36.64 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  36.64 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  23.94 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  26.05 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  36.64 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  31.87 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  31.87 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  32.26 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  32.69 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  32.47 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  32.68 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  29.01 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  28.23 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  26.41 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  32.48 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2031  DNA repair protein RecO  28.99 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0971735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2310  DNA repair protein RecO  36.11 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0770241  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  29.5 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  38.2 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  38.2 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  31.49 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  32.67 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  32.67 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  32.67 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  32.67 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  32.67 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  29.71 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2168  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  32.67 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1094  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0656  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1136  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  30.5 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  32.67 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  29.38 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4248  DNA repair protein RecO  32.67 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  25.89 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  29.14 
 
 		 336 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1012  DNA repair protein RecO  32 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  33.95 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1016  DNA repair protein RecO  32 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  32 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  31.62 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  23.81 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  28.65 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  30.15 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  31.28 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  28.65 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  31.52 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  26.82 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  32.3 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  24.75 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  24.75 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  24.75 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  24.75 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  21.3 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  24.75 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  29.63 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  24.75 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  24.75 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  34.38 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  24.75 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  32.65 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  24.24 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1087  DNA repair protein RecO  28.08 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  36.78 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  29.89 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  30.91 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  21.89 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  29.35 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  25.42 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  29.63 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  32.5 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  24.75 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  29.7 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  24.24 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  24.14 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  31.69 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  28.12 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  29.7 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  29.7 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  30.9 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  31.69 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2897  DNA repair protein RecO  29.33 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.64605  normal  0.158668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  32 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  31.52 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  29.82 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  29.82 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  29.82 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  29.82 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  29.82 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  29.35 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  30.99 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>