84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0311 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  99.16 
 
 		 239 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  84.45 
 
 		 237 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  62.66 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  61.92 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  58.75 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  54.51 
 
 		 242 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  49.79 
 
 		 248 aa  211  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  49.56 
 
 		 234 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  49.36 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  46.69 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  47.26 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  44.63 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  44.63 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  49.79 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  44.44 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  45.34 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  48.94 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  44.04 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  50.26 
 
 		 264 aa  185  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  44.75 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  44.75 
 
 		 256 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  46.09 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  45.13 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  45.08 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  44.44 
 
 		 249 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  43.44 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  43.44 
 
 		 246 aa  177  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  44.44 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  43.03 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  45.5 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  43.44 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  41.39 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  45.64 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  41.8 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  46.77 
 
 		 252 aa  164  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  41.56 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  33.74 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  37.86 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  30.86 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  44.44 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  30.45 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  34.47 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  37.35 
 
 		 192 aa  92  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  34.46 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  32.37 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  29.89 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  26.75 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  31.45 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  30.19 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  30.13 
 
 		 298 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  29.03 
 
 		 243 aa  48.5  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  30.19 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  30.91 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  29.68 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0408  DNA repair protein RecO  26.86 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  29.45 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  29.38 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  28.67 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  32.24 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  26.16 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  29.93 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  28.67 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  28.67 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  29.7 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0415  DNA repair protein RecO  24.57 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  24.09 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  27.16 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  27.22 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  29.11 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  29.19 
 
 		 243 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 236 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  26.82 
 
 		 248 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  27.22 
 
 		 245 aa  42  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  34.97 
 
 		 273 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  34.72 
 
 		 272 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  34.97 
 
 		 273 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1477  DNA repair protein RecO  33.79 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>