103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1181 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  99.59 
 
 		 246 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  95.51 
 
 		 246 aa  471  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  73.55 
 
 		 239 aa  345  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  73.17 
 
 		 246 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  72.76 
 
 		 267 aa  316  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  57.92 
 
 		 250 aa  275  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  56.25 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  54.81 
 
 		 249 aa  268  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  57.5 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  52.72 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  52.72 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  54.58 
 
 		 250 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  51.82 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  54.81 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  54.81 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  54.39 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  55.23 
 
 		 262 aa  255  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  54.39 
 
 		 256 aa  255  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  57.32 
 
 		 248 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  52.72 
 
 		 249 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  57.27 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  51.46 
 
 		 254 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  50.21 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  50 
 
 		 242 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  50.22 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  43.35 
 
 		 234 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  43.44 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  43.44 
 
 		 239 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  46.19 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  44.49 
 
 		 241 aa  174  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  43.62 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  42.44 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  43.8 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  41.63 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  40.91 
 
 		 241 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  43.5 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  31.28 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  39.02 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  31.69 
 
 		 240 aa  121  9e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  30.04 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  36.27 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  36.02 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  41.26 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  35.48 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  32.7 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  36.64 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  34.36 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  35.66 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  32.73 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  33.53 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  33.54 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  33.54 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  33.54 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  33.53 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  35.71 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  35.67 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  35.09 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  32.39 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  37.01 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  32.39 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  32.39 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  32.39 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  32.39 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  32.95 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  32.43 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  32.39 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  32.39 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  32.39 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  32.39 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  32.39 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  32.39 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  32.39 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  32.39 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  31.29 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  27.49 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  29.75 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  31.82 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  29.01 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  28.77 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  32.69 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0974  DNA repair protein recO  31.79 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  28.12 
 
 		 298 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1123  DNA repair protein RecO  32.69 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1402  DNA repair protein RecO, putative  32.69 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2973  DNA repair protein RecO  32.79 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318586  hitchhiker  0.00228518 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  28.72 
 
 		 244 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1005  DNA repair protein recO  30.52 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  29.22 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  23.66 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  30.67 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  30.67 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  27.56 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  24.04 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  27.92 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0093  DNA repair protein RecO  30.71 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  24.39 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0996  DNA repair protein RecO  31.21 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>