62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1209 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 251 aa  480  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  53.88 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  44.44 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  44.86 
 
 		 237 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  44.49 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  43.62 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  42.04 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  42.91 
 
 		 241 aa  155  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  43.4 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  40.57 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  41.98 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  42.22 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  36.73 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  39.76 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  42.67 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  40.89 
 
 		 249 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  36.55 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  36.55 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  43.33 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  39.92 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  40.44 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  36.91 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  39.75 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  43.44 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  39.06 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  42.04 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  38.25 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  42.11 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  38.22 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  39.48 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  38.72 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  38.67 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  37.44 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  36.05 
 
 		 249 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  36.91 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  37.02 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  36.02 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  36.02 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  36.02 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  27.23 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  28.39 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  30.16 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  24.05 
 
 		 244 aa  85.9  6e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  30.22 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  31.12 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  27.22 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  29.63 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  26.45 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  28.05 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  29.52 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  55.26 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  55.26 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  55.26 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  55.26 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  55.26 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  27.11 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  26 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  30.25 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>