93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1915 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 262 aa  520  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  87.5 
 
 		 253 aa  431  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  78.54 
 
 		 254 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  82.57 
 
 		 249 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  81.74 
 
 		 249 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  79.34 
 
 		 250 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  75.31 
 
 		 248 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  60.42 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  54.77 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  54.77 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  54.77 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  55.23 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  56.2 
 
 		 248 aa  254  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  54.81 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  53.53 
 
 		 243 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  53.04 
 
 		 256 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  53.14 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  51.01 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  54.29 
 
 		 247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  53.11 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  55.27 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  53.88 
 
 		 264 aa  238  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  47.52 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  54.62 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  54.2 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  45.93 
 
 		 244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  45.71 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  45.08 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  44.67 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  46.88 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  43.11 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  41.87 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  43.82 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  42.56 
 
 		 237 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  43.95 
 
 		 242 aa  165  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  41.6 
 
 		 243 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  44.08 
 
 		 243 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  40.65 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  41.98 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  30.34 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  32.26 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  30.7 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  38.1 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  29.5 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  34.23 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  30.65 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  32.4 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  31.32 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1123  DNA repair protein RecO  33.12 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1402  DNA repair protein RecO, putative  33.12 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  30.73 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  29.38 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  26.51 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  31.54 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  23.42 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2973  DNA repair protein RecO  30.17 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318586  hitchhiker  0.00228518 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  28.3 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  28.3 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  25.65 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  28.3 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  28.34 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1377  DNA repair protein RecO  32.5 
 
 		 243 aa  49.3  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  25.84 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  31.61 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  31.38 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  25.55 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1633  DNA repair protein RecO  31.97 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.183624  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1446  DNA repair protein RecO  31.87 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.817511  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  29.01 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  31.54 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  33.77 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  23.05 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  23.37 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  23.6 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  29.63 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  31.54 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  26.14 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  26.4 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4747  DNA repair protein RecO  35.42 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  24.47 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  26.99 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2084  DNA repair protein RecO  28.04 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.987652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  28.07 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  26.32 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  25.62 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  26.4 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  25.41 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2927  DNA repair protein RecO  30.82 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 300 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  29.67 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54300  DNA repair protein RecO  35.14 
 
 		 233 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>