157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0475 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  100 
 
 
245 aa  503  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  57.32 
 
 
243 aa  299  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  56.07 
 
 
247 aa  289  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  56.07 
 
 
247 aa  289  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  53.68 
 
 
248 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  53.19 
 
 
256 aa  257  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  52.77 
 
 
256 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  52.61 
 
 
249 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  50.62 
 
 
246 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  50.21 
 
 
246 aa  245  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  50.21 
 
 
246 aa  245  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  51.27 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  51.25 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  51.25 
 
 
267 aa  231  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  48.79 
 
 
250 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  49.15 
 
 
264 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  47.77 
 
 
249 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  48.58 
 
 
247 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  47.37 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  47.52 
 
 
262 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  48.52 
 
 
253 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  47.28 
 
 
242 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  47.3 
 
 
254 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  47.5 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  48.28 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  43.53 
 
 
234 aa  181  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  41.81 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  41.39 
 
 
239 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  41.39 
 
 
239 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  38.78 
 
 
252 aa  168  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  40.24 
 
 
242 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  40.57 
 
 
237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  36.51 
 
 
241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  37.6 
 
 
241 aa  148  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  37.45 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  38.14 
 
 
243 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  36.89 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 
244 aa  139  3e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  38.84 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  36.33 
 
 
251 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  33.06 
 
 
240 aa  124  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  31.28 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  32.49 
 
 
237 aa  104  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  36.88 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  33.11 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  34.84 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  26.05 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  27.55 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  31.25 
 
 
244 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  32.5 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  26.74 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  33.74 
 
 
245 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  31.06 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  33.74 
 
 
245 aa  58.9  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1402  DNA repair protein RecO, putative  33.96 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  32.35 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1123  DNA repair protein RecO  33.96 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  32.56 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  29.52 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  30.97 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  34.05 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  34.05 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  36 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  31.45 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  31.45 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  31.45 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  31.45 
 
 
242 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  31.45 
 
 
242 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  31.45 
 
 
242 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  26.73 
 
 
248 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  31.45 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  31.45 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  26.97 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  31.45 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  28.4 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  31.45 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  31.45 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  32.08 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1477  DNA repair protein RecO  32.64 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  30.97 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4747  DNA repair protein RecO  32.53 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  25.91 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  29.82 
 
 
298 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  30.82 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 
242 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0996  DNA repair protein RecO  30.82 
 
 
229 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0866  DNA repair protein RecO  29.52 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0186156 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1010  DNA repair protein RecO  29.52 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  29.67 
 
 
249 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  28.34 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54300  DNA repair protein RecO  31.93 
 
 
233 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  26.11 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  29.03 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  25.67 
 
 
253 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  31.51 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>