45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1084 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  100 
 
 		 192 aa  370  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  51.52 
 
 		 243 aa  174  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  45.79 
 
 		 202 aa  150  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  33.19 
 
 		 234 aa  91.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  37.35 
 
 		 239 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  34.67 
 
 		 242 aa  91.3  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  42.67 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  32.61 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  39.73 
 
 		 243 aa  88.2  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  31.9 
 
 		 244 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  32.61 
 
 		 237 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  41.5 
 
 		 241 aa  85.1  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  38.32 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  38.36 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  38.36 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  29.82 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  34.03 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  30.47 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  30.74 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  38.82 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  40.14 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  40.65 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  39.04 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  40.67 
 
 		 249 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  39.07 
 
 		 249 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  41.26 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  30.87 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  41.26 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  30.57 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  40 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  40.85 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  36.65 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  39.86 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  38.1 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  35.25 
 
 		 256 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  38.73 
 
 		 267 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  35.25 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  36.88 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  33.47 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  29.56 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  29.06 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  30.5 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  27.04 
 
 		 244 aa  43.1  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0652  DNA replication and repair protein RecO  32.61 
 
 		 274 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10662  normal  0.394042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>