50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4493 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 243 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  51.52 
 
 		 192 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  46.53 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  46.34 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  46.12 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  45.12 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  44.9 
 
 		 262 aa  164  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  39.26 
 
 		 202 aa  162  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  42.62 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  40.74 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  40.74 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  43.88 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  40.74 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  43.21 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  43.5 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  45.34 
 
 		 247 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  43.5 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  43.75 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  42.86 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  43.35 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  43.33 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  42.8 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  37.86 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  39.08 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  43.28 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  40.5 
 
 		 243 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  37.04 
 
 		 239 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  42.5 
 
 		 239 aa  148  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  37.34 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  43.57 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  42.19 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  41.03 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  41.18 
 
 		 250 aa  141  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  40 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  41.91 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  39.59 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  41.49 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  40.82 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  38.84 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  35.51 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  42.04 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  30.13 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  29.84 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  26.23 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  24.59 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  25.56 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  26.99 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  33.72 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  28.31 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>