72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2568 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 237 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  84.45 
 
 		 239 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  84.03 
 
 		 239 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  61.67 
 
 		 241 aa  274  9e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  59.83 
 
 		 244 aa  268  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  58.16 
 
 		 241 aa  265  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  52.79 
 
 		 242 aa  221  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  48.55 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  47.74 
 
 		 243 aa  197  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  47.79 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  45.68 
 
 		 247 aa  191  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  45.68 
 
 		 247 aa  191  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  46.78 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  49.78 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  45.99 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  48.51 
 
 		 242 aa  184  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  43.29 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  44.67 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  45.09 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  42.2 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  48.32 
 
 		 243 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  45.87 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  42.28 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  43.62 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  43.62 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  44.4 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  42.47 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  42.56 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  42.47 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  41.46 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  42.8 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  42.56 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  40.89 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  46.34 
 
 		 252 aa  164  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  40.57 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  40.42 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  41.32 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  30.49 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  44.86 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  37.34 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  32.23 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  34.39 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  29.75 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  32.61 
 
 		 192 aa  86.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  28.98 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  31.33 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  29.75 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  30.28 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  30.97 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  29.52 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  27.81 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  25.95 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  27.85 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  30.26 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0415  DNA repair protein RecO  25.42 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  28.66 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  27.32 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  30.52 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  36.11 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  35.42 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  30.63 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  36.11 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0408  DNA repair protein RecO  27.12 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  28.17 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  27.4 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  27.4 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  27.4 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>