119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3349 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 254 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  54.29 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  45 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  43.72 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  43.27 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  44.08 
 
 		 241 aa  161  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  43.46 
 
 		 234 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  42.02 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  42.21 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  41.67 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  42.04 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  41.56 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  41.32 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  41.9 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  41.8 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  43.8 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  39.84 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  36.89 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  40.24 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  39.43 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  38.78 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  41.15 
 
 		 252 aa  148  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  38.37 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  41.18 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  39.37 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  41.87 
 
 		 246 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  37.14 
 
 		 246 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  38.16 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  39.84 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  38.16 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  39.32 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  39.76 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  38.08 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  36.71 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  36.71 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  35.59 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  34.36 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  37.13 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  28.34 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  38.36 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  30.58 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  28.74 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  31.44 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  37.75 
 
 		 202 aa  85.1  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  30.09 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  27.87 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  29.55 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  28.25 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  32.94 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  30.81 
 
 		 209 aa  52.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  32.93 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  30.99 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  31.68 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  31.68 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  31.68 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  32.35 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  30.18 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  30.18 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  30.18 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  30.18 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  30.18 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  30.18 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  30.41 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  30.18 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  30.18 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  30.18 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  28.65 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  30.32 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  30.19 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  30.19 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  30.19 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  30.19 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  30.19 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  30.19 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  30.19 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  31.85 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  30.54 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 336 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  29.56 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1087  DNA repair protein RecO  29.11 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  25.97 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  29.8 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  29.88 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  29.59 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2897  DNA repair protein RecO  29.11 
 
 		 309 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.64605  normal  0.158668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2031  DNA repair protein RecO  29.3 
 
 		 242 aa  45.4  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0971735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  28.74 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1349  DNA repair protein RecO  45.61 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.170679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2168  DNA repair protein RecO  30.19 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  22.49 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  22.49 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  28.46 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  22.49 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  21.95 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>