93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1849 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 252 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  49.6 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  46.77 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  47.76 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  46.34 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  45.97 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  47.66 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  44.3 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  43.95 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  45.53 
 
 		 248 aa  187  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  44.44 
 
 		 249 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  45.27 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  44.67 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  45.75 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  40.25 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  43.32 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  44.03 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  40.25 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  41.91 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  43.67 
 
 		 246 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  43.82 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  43.67 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  43.67 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  43.27 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  42.86 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  39.59 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  40 
 
 		 243 aa  178  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  40.66 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  43.33 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  43.62 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  40.66 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  46.12 
 
 		 242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  43.32 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  40.66 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  45.9 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  41.15 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  42.86 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  30.33 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  41.98 
 
 		 243 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  29.88 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  29.75 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  41.3 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  31.84 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  33.47 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  34.72 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  30.59 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  29.63 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  29.63 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  29.63 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  28.05 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  29.55 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  28.74 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  30.56 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  32.24 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  29.63 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  29.01 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  31.15 
 
 		 300 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  29.56 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2973  DNA repair protein RecO  34.52 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318586  hitchhiker  0.00228518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  33.33 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  28.72 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  29.71 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  26.01 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  27.88 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  28.48 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  28.48 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  28.32 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  26.23 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  26.79 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  29.92 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  28.92 
 
 		 262 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  24.9 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  26.85 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  31.48 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  26.8 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  25.79 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  29.09 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0882  DNA repair protein RecO  51.06 
 
 		 224 aa  42.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  28.14 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  34.18 
 
 		 254 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>