98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2876 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  51.3 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  50.22 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  50.22 
 
 		 246 aa  215  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  50.22 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  50.66 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  49.79 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  49.79 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  50.43 
 
 		 243 aa  201  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  51.74 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  52.21 
 
 		 246 aa  198  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  49.78 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  48 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  47.87 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  48.34 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  48.48 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  46.75 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  42.79 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  46.22 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  46.88 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  45.97 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  42.79 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  42.79 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  45.98 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  47.69 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  48 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  45.61 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  44.83 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  44.68 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  46.58 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  47.3 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  41.81 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  42.79 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  47.14 
 
 		 242 aa  178  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  47.09 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  45.96 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  44.54 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  43.1 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  42.98 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  27.43 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  30.7 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  33.7 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  27.85 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  33.19 
 
 		 192 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  37.59 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  28.1 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  29.81 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  30.26 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  30.26 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  34.39 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  30.43 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  32.89 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  30.13 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  28.29 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  34.25 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  27.5 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  30.87 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  26.75 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1123  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1402  DNA repair protein RecO, putative  33.33 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  27.56 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  27.56 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  27.56 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  27.56 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0408  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  26.92 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  29.34 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  29.34 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  29.34 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  29.34 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  29.34 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  27.81 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  30.46 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  28.14 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  29.34 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1010  DNA repair protein RecO  34.56 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0866  DNA repair protein RecO  34.56 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0186156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  27.75 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  28.67 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03405  DNA repair protein RecO  26.57 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2168  DNA repair protein RecO  29.33 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  26.83 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2084  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.987652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  24.67 
 
 		 235 aa  42  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>