56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0219 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  100 
 
 
240 aa  490  9.999999999999999e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  46.25 
 
 
244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  45 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  33.74 
 
 
239 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  33.74 
 
 
239 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  32.23 
 
 
237 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  31.95 
 
 
244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  37.96 
 
 
237 aa  144  9e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 
243 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  33.62 
 
 
249 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  33.2 
 
 
245 aa  139  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  32.75 
 
 
249 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  31.82 
 
 
246 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  32.16 
 
 
254 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  30.58 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  30.34 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  32.37 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  31.69 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  29.78 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  32 
 
 
264 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  28.69 
 
 
256 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  30.8 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  30.6 
 
 
248 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  31.28 
 
 
246 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  31.69 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  32 
 
 
242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  30.71 
 
 
247 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  30.67 
 
 
253 aa  129  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  27.43 
 
 
249 aa  128  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  32.27 
 
 
250 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  30.7 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  31.69 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  28.34 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  28.34 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  28.93 
 
 
239 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  29.88 
 
 
252 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 
234 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  30.86 
 
 
254 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  30.84 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  30.13 
 
 
243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  29.75 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  27.97 
 
 
251 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  22.27 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  23.93 
 
 
244 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  27.67 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  23.65 
 
 
202 aa  52  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  28.41 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  27.81 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  26.58 
 
 
192 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  26.15 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  22.73 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  22.29 
 
 
217 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0186  DNA repair protein RecO  23.73 
 
 
232 aa  42.7  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.93882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  21.18 
 
 
217 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  23.12 
 
 
244 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>