48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0461 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  100 
 
 
237 aa  481  1e-135  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  37.76 
 
 
240 aa  151  8e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  32.73 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  35.45 
 
 
254 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  32.44 
 
 
256 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  30.83 
 
 
247 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  35.71 
 
 
241 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  34.09 
 
 
244 aa  124  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  33.18 
 
 
249 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  32.02 
 
 
256 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  32.73 
 
 
248 aa  121  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  32.73 
 
 
249 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  33.06 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  37.57 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  32.73 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  32.58 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  33.06 
 
 
239 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  30.45 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  32.59 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  33.03 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  35 
 
 
244 aa  115  5e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  35.98 
 
 
248 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  32.13 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  32.27 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  32.07 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  32.07 
 
 
246 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 
234 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  28.89 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  34.09 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  33.61 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  32.07 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  32.13 
 
 
242 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  29.63 
 
 
252 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  28.23 
 
 
247 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  28.23 
 
 
247 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  32.28 
 
 
241 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  32.07 
 
 
267 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  30.45 
 
 
245 aa  104  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  33.86 
 
 
239 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  29.58 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  27.12 
 
 
251 aa  89.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  28.38 
 
 
243 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  23.01 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  24.43 
 
 
248 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  23.38 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  24.84 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  25.3 
 
 
244 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>