78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1740 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 243 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  47.66 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  50.43 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  47.46 
 
 		 246 aa  198  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  47.46 
 
 		 246 aa  198  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  46.19 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  48.32 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  45.64 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  43.98 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  46.15 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  47.66 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  44.17 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  44.81 
 
 		 239 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  44.02 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  45.23 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  41.8 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  41.8 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  43.7 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  43.42 
 
 		 256 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  47.23 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  42.79 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  42.49 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  42.02 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  41.28 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  41.63 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  42.44 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  40.16 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  42.48 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  44.78 
 
 		 242 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  42.49 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  38.46 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  40.95 
 
 		 248 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  43.62 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  38.56 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  40.76 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  41.32 
 
 		 243 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  38.79 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  41.98 
 
 		 252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  42.92 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  29.54 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  35.68 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  28.69 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  31.3 
 
 		 192 aa  93.2  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  33.52 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  33.98 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  30.17 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  31.1 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  27.04 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  27.93 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  27.93 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  27.93 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  27.93 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  27.93 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  29.89 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  24.02 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  25.79 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  29.89 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  28.89 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  22.73 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  25.15 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  25.15 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  25.15 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1402  DNA repair protein RecO, putative  28.3 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1123  DNA repair protein RecO  28.3 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  32.52 
 
 		 249 aa  42  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>