81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1568 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 234 aa  473  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  51.3 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  48.92 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  49.56 
 
 		 239 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  49.12 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  49.36 
 
 		 244 aa  201  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  46.09 
 
 		 243 aa  198  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  45.11 
 
 		 247 aa  194  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  45.11 
 
 		 247 aa  194  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  43.86 
 
 		 248 aa  193  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  47.79 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  46.26 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  43.66 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  45.79 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  43.35 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  43.35 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  43.35 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  47.66 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  42.24 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  44.59 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  42.17 
 
 		 250 aa  184  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  45.41 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  44.25 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  43.53 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  44.93 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  42.49 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  43.36 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  42.22 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  42.22 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  43.23 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  42.22 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  43.11 
 
 		 262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  40.89 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  43.3 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  44.3 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  42.24 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  43.33 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  37.82 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  29.79 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  41.78 
 
 		 251 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  34.72 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  28.09 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  30.74 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  33.33 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  30.25 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  32.12 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  30.36 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  29.34 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  29.8 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  29.09 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  29.68 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  29.09 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  29.09 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  29.09 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  29.17 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  29.09 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  28.87 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  25.95 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  25.95 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  25.95 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  29.22 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  27.63 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  23.78 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  27.49 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  30.32 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  23.75 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0736  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.394466  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  29.01 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  29.19 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  26.09 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  26.9 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  25.49 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>