213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3710 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 240 aa  493  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03405  DNA repair protein RecO  43.67 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  42.22 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2720  DNA repair protein RecO  44.05 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2851  DNA repair protein RecO  44.05 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2718  DNA repair protein RecO  44.05 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888529  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02459  DNA repair protein RecO  44.05 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1103  DNA repair protein RecO  44.05 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0298375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3801  DNA repair protein RecO  44.05 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1112  DNA repair protein RecO  44.05 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02423  hypothetical protein  44.05 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2741  DNA repair protein RecO  43.36 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2845  DNA repair protein RecO  43.36 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.789708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2822  DNA repair protein RecO  43.56 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2782  DNA repair protein RecO  43.36 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  42.48 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  40 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3052  DNA repair protein RecO  42.04 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  42.48 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2930  DNA repair protein RecO  43.61 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.4363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1435  DNA repair protein RecO  44.2 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  41.59 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  41.59 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  41.59 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4286  DNA repair protein RecO  43.75 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  42.04 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  42.04 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  42.04 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54300  DNA repair protein RecO  43.44 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  39.91 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  38.94 
 
 		 242 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4747  DNA repair protein RecO  42.99 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0996  DNA repair protein RecO  42.92 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1075  DNA repair protein RecO  45.13 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4372  DNA repair protein RecO  43.05 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1477  DNA repair protein RecO  41.89 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3024  DNA repair protein RecO  41.05 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  41.59 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3110  DNA repair protein RecO  41.18 
 
 		 236 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0026851  normal  0.0227356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2928  DNA repair protein RecO  41.52 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1280  DNA repair protein RecO  40.72 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.588723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1203  DNA repair protein RecO  41.18 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0374149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1247  DNA repair protein RecO  41.18 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00802629  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  40.54 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2846  DNA repair protein RecO  41.07 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.403823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  40.44 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4215  DNA repair protein RecO  41.78 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.322545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3949  DNA repair protein RecO  42.22 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1350  DNA repair protein RecO  41.07 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1161  DNA repair protein RecO  39.82 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.218287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13820  DNA repair protein RecO  40 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  39.44 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2310  DNA repair protein RecO  37.5 
 
 		 252 aa  151  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0770241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0642  DNA repair protein RecO  36.96 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.272971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  37.86 
 
 		 246 aa  148  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  35.4 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1633  DNA repair protein RecO  37.12 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.183624  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0093  DNA repair protein RecO  41.62 
 
 		 202 aa  139  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1245  DNA repair protein RecO  38.16 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000428511  unclonable  0.0000000123287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2927  DNA repair protein RecO  38.79 
 
 		 240 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1150  DNA repair protein RecO  40.62 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0882  DNA repair protein RecO  38.46 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  37.33 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1056  DNA repair protein RecO  40.27 
 
 		 231 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0794  recombination protein O, RecO  40.44 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  36.56 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  34.82 
 
 		 336 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2897  DNA repair protein RecO  35.81 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.64605  normal  0.158668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1039  DNA repair protein RecO  34.67 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.109115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2031  DNA repair protein RecO  34.62 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0971735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0974  DNA repair protein recO  31.9 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  35.65 
 
 		 286 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2168  DNA repair protein RecO  35.81 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  34.93 
 
 		 286 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1005  DNA repair protein recO  31.47 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  34.06 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  34.93 
 
 		 286 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1087  DNA repair protein RecO  34.5 
 
 		 306 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  34.93 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  34.93 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  34.93 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  34.93 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  34.93 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0736  DNA repair protein RecO  37.24 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.394466  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4248  DNA repair protein RecO  34.78 
 
 		 278 aa  121  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  32.6 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0408  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2764  DNA repair protein RecO  36.32 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  33.48 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0415  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2084  DNA repair protein RecO  33.9 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.987652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1016  DNA repair protein RecO  33.91 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1012  DNA repair protein RecO  33.91 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39895  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1386  DNA repair protein RecO  34.65 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0866  DNA repair protein RecO  37.78 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0186156 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1010  DNA repair protein RecO  37.78 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1094  DNA repair protein RecO  34.35 
 
 		 278 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0656  DNA repair protein RecO  34.35 
 
 		 278 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1136  DNA repair protein RecO  34.35 
 
 		 278 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  32.34 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>