86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0186 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0186  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 232 aa  484  1e-136  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.93882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  33.77 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  31.79 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  31.13 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  34.64 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  31.5 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  33.11 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  28.28 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  34.19 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  27.46 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  31.76 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  28.87 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  30.41 
 
 		 253 aa  62  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  27.84 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  30.82 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  30.32 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  28 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  30.82 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  29.68 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  26.46 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  26.71 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  26.98 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  27.4 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  26.9 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  26.9 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  28.86 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  24.82 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  28.83 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  25.17 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  28.28 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  23.45 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  25.12 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  27.03 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  23.94 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  29.05 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  28.17 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  27.03 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  32.26 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  24.74 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  27.75 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  26.32 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  23.78 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  26.71 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  25.32 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  26.03 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  24.16 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  26.76 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  27.08 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  25.21 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  22.75 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  28.29 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  24.79 
 
 		 256 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  24.48 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  26.24 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  26.24 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  25.34 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  22.69 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  25.17 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  29.53 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  21.99 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  26.24 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  24.21 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  22.84 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1572  DNA repair protein RecO  25.69 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  28.38 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  24.54 
 
 		 288 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  26.9 
 
 		 284 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  24.31 
 
 		 254 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  25.39 
 
 		 281 aa  42  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  27.63 
 
 		 276 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  27.63 
 
 		 276 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  27.63 
 
 		 276 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1377  DNA repair protein RecO  26.75 
 
 		 243 aa  41.6  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  22.73 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>