133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4604 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 288 aa  587  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  50.85 
 
 		 296 aa  281  8.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  49.83 
 
 		 302 aa  275  8e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  53.17 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  51.41 
 
 		 273 aa  271  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  51.06 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  44.74 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  42.81 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1733  putative recombination protein O  35.52 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.615018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  30.59 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04501  putative recombination protein O  35.56 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04181  putative recombination protein O  29.21 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.749195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04491  putative recombination protein O  31.72 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.741842  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03961  putative recombination protein O  28.57 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0394  putative recombination protein O  28.15 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.023387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  26.94 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04601  putative recombination protein O  29.26 
 
 		 259 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  25.91 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  28.36 
 
 		 273 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  28.1 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  31.05 
 
 		 253 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  27.74 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2015  DNA replication and repair protein RecO  33.5 
 
 		 257 aa  93.2  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  25.81 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  25.51 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21431  putative recombination protein O  27.68 
 
 		 267 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  26.86 
 
 		 244 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  35.26 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  27.34 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  27.84 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  26.58 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  32.93 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  26.47 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0656  recombination protein O, RecO  27.08 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  27.11 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  32.47 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  32.63 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  32.64 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  28.42 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  28.27 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  28.5 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  30.95 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  31.09 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  32.11 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  33.53 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  29.53 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  28.06 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  28.06 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  28.06 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  30.85 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  28.12 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  28.06 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  26.97 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  28.99 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  27.55 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  29.69 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  27.69 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  24.63 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  27.8 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  31.62 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  43.04 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  29.84 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  30.11 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  29.34 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  30.86 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  25.74 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  29.56 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  29.47 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  28.12 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  29.01 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  28.14 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  29.34 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  28.95 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  30.2 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  29 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  30.36 
 
 		 244 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  35.83 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  24.71 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  41.03 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  23.6 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  24.62 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  28.5 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  27.84 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  28.66 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  28.66 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  25.68 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  24.73 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  25.25 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  28.66 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  24.46 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  24.46 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  24.62 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  23.66 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  23.66 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  24 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  23.66 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  21 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  30.08 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>