52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1572 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1572  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 219 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  29.25 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0837  Recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  28.22 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  23.76 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  28.05 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  29.2 
 
 		 273 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  24.03 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  29.2 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  23.97 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 244 aa  51.6  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  30.97 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  20.95 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  28 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  22.29 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  22.6 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 283 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  20.61 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  27 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  30.36 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  26.47 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  28.3 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  26.42 
 
 		 248 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  20.27 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  21.5 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  27.36 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  28.79 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  27.36 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  27.36 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  27.36 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  27.36 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  27.36 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  27.36 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  23.01 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  21.92 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  24.18 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0186  DNA repair protein RecO  25.69 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.93882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  28.31 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0450  DNA repair protein RecO  23.76 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.207169 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  25.5 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  25.75 
 
 		 266 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  23.44 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  25.17 
 
 		 288 aa  43.5  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  20.4 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  19.05 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  24.62 
 
 		 283 aa  42.4  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  35.09 
 
 		 248 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  20.51 
 
 		 262 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  23.08 
 
 		 260 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  29.03 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>