99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2799 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 261 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  59 
 
 		 261 aa  315  6e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  57.36 
 
 		 283 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  56.32 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2037  recombination protein O, RecO  56.11 
 
 		 264 aa  271  7e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0117854  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  45.17 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  42.08 
 
 		 261 aa  228  9e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  29.87 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  25.82 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  22.58 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  28.4 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  28.41 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  26.25 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  25.57 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  27.81 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  23.46 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  28.85 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  26.2 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  27.16 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1264  DNA repair protein RecO  27.39 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  26.46 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  40 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  23.78 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  24.44 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  24.44 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  24.44 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  24.44 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  24.44 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  24.44 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  24.05 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  26.09 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  24.41 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  24.73 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  26.97 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  24.75 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  23.23 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  23.66 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  26.67 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  25.97 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  25.41 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  24.53 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  24.41 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  25.85 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  26.75 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  22.15 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  23.75 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  25.62 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  24.9 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  24.39 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  24.63 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  23.94 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  23.7 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  23.59 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  24.53 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  22.36 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  24.69 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  24.9 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  25.64 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  27.16 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  27.16 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  24.52 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  22.98 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  23.89 
 
 		 257 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  27.72 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0914  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  22.88 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  28.47 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  23.75 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  26.71 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  21.43 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  23.53 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  24.2 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  22.31 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  21.01 
 
 		 273 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  23.31 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  24.05 
 
 		 245 aa  45.8  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  25 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  24.68 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  24.48 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  25.61 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  21.29 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1572  DNA repair protein RecO  23.01 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  21.29 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  22.79 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  21.29 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2031  DNA repair protein RecO  34.78 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0971735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  22.09 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  21.94 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  22.08 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  22.64 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  21.94 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  25.16 
 
 		 279 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0506  DNA repair protein RecO  25.14 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00293649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>