46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0462 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 243 aa  503  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  36.36 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  35.8 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  34.02 
 
 		 231 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  33.74 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  30.58 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  36.91 
 
 		 217 aa  110  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  30.08 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  29.18 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  30.08 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  34.67 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  31.25 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  30.67 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  31.82 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  27.24 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  40 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2037  recombination protein O, RecO  37.66 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0117854  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  28.83 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  30.82 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  30.82 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  30.82 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  24.88 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  25.23 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  23.02 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  25.49 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  25.79 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  21.85 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  27.13 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  46.81 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  28.35 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  44.68 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  25.44 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  46.81 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  25.2 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  44.68 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  44.68 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  44.68 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  25.33 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  44.68 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  44.68 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  44.68 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  44.68 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  27 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  42.22 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>